Apotek pendidikan STFI berdiri di Jl. Parakan Resik no. 7 atau berada di sebelah gedung 3 yang didirikan sebagai salah satu syarat pendirian Program Studi Profesi Apoteker (PSPA). Apotek pendidikan dipimpin oleh apoteker penanggungjawab Deby Tristyanti, S.Farm.,Apt. Apotek dilengkapi dengan fasilitas yang disesuaikan dengan peraturan apotek.
Apotek pendidikan merupakan apotek komersial yang terbuka untuk umum, disisi lain merupakan tempat belajar mahasiswa untuk memahami proses kerja apoteker pada bidang pelayanan.
